REAGENTS
 
Inducers of NF-kB activity
  • Bacteria and Fungi
  • Bacterial or Fungal Products
  • Viruses
  • Viral Products
  • Eukaryotic parasite
  • (Inflammatory) Cytokines
  • Physiological (Stress) Conditions
  • Physical Stress
  • Oxidative Stress
  • Environmental Hazards
  • Therapeutically used drugs
  • Modified Proteins
  • Overexpressed Proteins (ER Overload sometimes)
  • Receptor Ligands
  • Apoptotic Mediators
  • Mitogens, Growth Factors and Hormones
  • Physiological Mediators
  • Chemical Agents

    • Bacteria and Fungi
    Organism Reference
    Actinobacillus actinomycetemcomitans  Tiranathanagul et al, 2004
    Alloiococcus otitidis Harimaya et al, 2007
    Anaplasma phagocytophilum Choi et al, 2004; Lee & Goodman, 2006
    Angelica gias Nakai Kim et al, 2007
    Angiostrongylus cantonensis Lan et al, 2004
    Aspergillus fumigatus Gao & Wu, 2006
    Atopobium vaginae Libby et al, 2008
    Bacteroides fragilis Kim et al, 2006
    Bacteroides forsythus Hasebe et al, 2004
    Bartonella henselae Kempf et al, 2005; Dehio et al, 2005
    Bifodobacterium infantis O'Hara et al, 2006
    Bordetella pertussis Ishibashi & Nishikawa, 2003
    Borrelia burgdorferi (Lyme Disease spirochete) Ebnet et al, 1997
    Brucella abortus Pei et al, 2008
    Campylobacter jejuni Hu & Hickey, 2005; Hu et al, 2006
    Castanopsis cuspidate Kang et al, 2007
    Chlamydia pneumoniae Gencay et al, 2003; Opitz et al, 2005
    Citrobacter rodentium Khan et al, 2006
    Clostridium difficile Kim et al, 2006
    Cryptococcus neoformans Pietrella et al, 2005
    Cryptosporidium Asaad & Sadek , 2006
    Echinococcus granulosus Rigano et al, 2006
    Edwardsiella tarda Okuda et al, 2006
    Ehrlichia chaffeensis Zhang et al, 2004
    Eimeria alabamensis Alcala-Canto & Ibarra-Velarde, 2008
    Eimeria bovis Alcala-Canto & Ibarra-Velarde, 2008
    EPEC, enterophathogenic E. coli Savkovic et al, 1997
    Escherichia coli Kim et al, 2005
    Francisella tularensis Katz et al, 2006; Butchar et al, 2007; Cole et al, 2007
    Fusobacterium nucleatum Huang et al, 2004
    Ganoderma lucidum Lin et al, 2005, 2006
    Gardnerella vaginalis Hashemi et al, 1999
    Helicobacter pullorum Varon et al, 2008
    Helicobacter pylori Münzenmaier et al, 1997
    Lactobacilli Klebanoff et al, 1999
    Lactobacillus salivarius O'Hara et al, 2006
    Lactococcus lactis Tohno et al, 2007
    Legionella pneumophila Abu-Zant et al, 2006; Schmeck et al, 2006
    Leshmania donovani Ghosh et al, 2006
    Listeria monocytogenes Hauf et al, 1994
    Moraxella catarrhalis Slevogt et al, 2006; N'guessan et al, 2007
    Mycobacterium bovis bacillus Mendez-Samperio et al, 2007
    Mycoplasma fermentans Marie et al, 1999
    Mycoplasma genitalium Qiu et al, 2007; You et al, 2008
    Mycoplasma hyorhinis Kagemann et al, 2005
    Mycoplasma pneumoniae Shimizu et al, 2005
    Mycobacteria tuberculosis Zhang et al, 1994
    Neisseria gonorrhoeae Naumann et al, 1997
    Neisseria meningiditis Constantin et al, 2004
    Pneumocystis murina Zhang et al, 2006
    Porphyromonas gingivalis Kobayashi-Sakamoto et al, 2004; Walter et al, 2004
    Prevotella intermedia Kim et al, 2004
    Pseudomonas aerugenosa Cannon et al, 2003
    Rhodobacter sphaeroides Lohmann et al, 2007
    Rhodococcus equi Darrah et al, 2004
    Rickettsia rickettsii Sporn et al, 1997
    Salicornia herbacea Lee et al, 2005
    Salmonella dublin Eaves-Pyles et al, 1999
    Salmonella enterica Savannovong et al, 2007
    Salmonella typhimurium Hobbie et al, 1997
    Serratia marcescens Kida et al, 2006
    Shigella dysenteriae type I Biswas et al, 2006
    Shigella flexneri Dyer et al, 1993
    Spirulina Balachandran et al, 2006
    Staphyllococcus aureus Busam et al, 1992
    Streptococci (group A) Medina et al, 2002
    Streptococcus (group B) Glibetic et al, 2001
    Streptomyces californicus (fungus) Huttunen et al, 2004
    Taenia solium Uddin et al, 2006
    Treponema denticola Tanabe et al, 2008
    Trichomonas vaginalis Chang et al, 2004
    Ureaplasma parvum Shimizu et al, 2008
    Ureaplasma urealyticum Li et al, 2000
    Vibrio vulnificus Lee et al, 2006
    Yersinia enterocolitica Elewaut et al, 1999

    Bacterial or Fungal Products
    Molecule Reference
    Angelan (Angelica gigas Nakai) Kim et al, 2007
    Antigen B (Echinococcus granulosus) Rigano et al, 2006
    Apicidin (HDAC inhibitor) Kim et al, 2006
    Apicularen A Hong et al, 2004
    Bacterial extract OM-85-BV Huber et al, 2005
    CagA (Heliobacter pylori) Brandt et al, 2005
    CpG Krieg, 2000
    Cytolysin (Vibrio vulnificus) Kang et al, 2002
    Deoxynivalenol (Mycoplasma) Van De Walle et al, 2008
    Diphosphoryl lipid A (Rhodobacter sphaeroides) Lawrence et al, 1995
    Enterotoxin (Bateroides fragilis) Wu et al, 2004
    Exotoxin B Busam et al, 1992
    Fimbria protein ATTLE (P gingivalis) Ogawa et al, 2002
    Flagellin (E coli Nissle 1917) Schlee et al, 2007
    Flagellin (Pseudomonas aerugenosa) Tseng et al, 2005
    Flagellin FlaB (Vibrio vulnificus) Lee et al, 2006
    Flagellins FliC, FljB (Salmonella) Simon & Samuel, 2007
    Fumonisin B1 (Fusarium verticillioides) Gopee & Sharma, 2004
    G(Anh) M Tetra (E coli) Dokter et al, 1994
    Glycosylphosphatidylinositols (Plasmodium falciparum) Zhu et al, 2004
    Hemagluttin B (Porphyromonas gingivalis) Zhang et al, 2005
    JHP940 (Heliobacter phylori) Rizwan et al, 2007
    Lipoprotein LpK (Mycobacterioum leprae) Yamashita et al, 2004
    Lipoteichoic acid (Listeria) Hauf et al, 1997; Kao et al, 2005
    Lipopeptides (Mycoplasmia pneumoniae) Shimizu et al, 2007
    Lipoproteins (Ureaplasma parvum) Shimizu et al, 2008
    Lipopolysaccharide (LPS) Sen & Baltimore, 1986
    Membrane lipoproteins (Mycoplasma fermentans) Garcia et al, 1998; Rawadi et al, 1999
    Membrane lipoproteins (Mycoplasma penetrans) Zeng et al, 2004
    Membrane lipoproteins (Mycoplasma genitalium) Qiu et al, 2007
    Dipalmitoylated lipoproteins (Mycoplasma pneumoniae) Shimizu et al, 2005
    Mannoproteins (Cryptococcus neoformans) Pietrella et al, 2005
    Muramyl Peptides Schreck et al, 1992
    Mycobacterium lipoarabinomannan Tapping & Tobias, 2003
    Oligodeoxynucleotide (Mycobacterium bovis) Lee et al, 2006
    Oligodeoxynucleotide (Escherichia coli) Choi et al, 2006
    Peptidoglycan (Lactobacillus) Sun et al, 2005
    PlcA (Phospholipase) (Listeria) Hauf et al, 1997
    PlcB (Phospholipase) (Listeria) Hauf et al, 1997
    Polysaccharides (Salicornia herbacea) Lee et al, 2005
    Polysaccharides (Ganoderma lucidum) Lin et al, 2006
    Polysaccharides (Spirulina) Balachandran et al, 2006
    Polysaccharides (Lactococcus lactis) Tohno et al, 2007
    Porin (Shigella dysenteriae) Biswas et al, 2006
    Porins (Gram negative bacteria) Perfetto et al, 2003
    PS-G (Ganoderma lucidum) Lin et al, 2005
    Porin 1B (Gonoccocus) Binnicker et al, 2004
    Serralysin (Serratia marcescens) Kida et al, 2006
    Staphylococcus enterotoxin A and B (super antigen) Trede et al, 1993; Busam et al, 1992
    Tip-alpha (Heliobacter pylori) Suganuma et al, 2006; Kuzuhara et al, 2007
    Toxic Shock Syndrome Toxin 1 Trede et al, 1993
    Toxin A (Clostridium difficile) Kim et al, 2006
     Triacylated lipoproteins (Mycoplasma pneumoniae; M. genitalium) Shimizu et al, 2007; 2008
    Type IVB Pili (Salmonella typhi) Wang et al, 2005
    Urease B (Heliobacter pylori) Beswick et al, 2006
    UspA1 (Moraxella catarrhalis) N'guessan et al, 2007
    Wogonin (Scutellaria baicalensis) Chiu et al, 2002

    Viruses
    Virus Reference
    Adenovirus Shurman et al, 1989
    Avian influenza virus (H5NI, HIN1) Lee et al, 2005
    Cytomegalovirus Sambucetti et al, 1989
    Ebola  Martinez et al, 2007
    Epstein-Barr Virus (EBV) Hammarskjöld & Simurda, 1992
    Encephalomyocarditis virus Moran et al, 2005
    Flavavirus (Japanese Encephalitis virus; Dengue Virus serotype 2) Chang et al, 2005: Medin et al, 2005
    Hepatitis B Virus Siddiqui et al, 1989
    Herpes Virus Saimiri Yao et al, 1995; Cho et al, 2006
    Human Herpesvirus 6 Ensoli et al, 1989
    HIV-1 Bachelerie et al, 1991
    Herpex Simplex Virus -1 Gimble et al, 1988
    Herpex Simplex Virus -2 Yedowitz & Blaho, 2005
    Human metapneumovirus Bao et al, 2007
    Human Papillomavirus-like particles Yan et al, 2005
    Human Papillomavirus type 16 James et al, 2006
    HTLV-I Leung & Nabel, 1988; Ballard et al, 1988
    Influenza Virus Ronni et al, 1997; Sun et al, 2005
    Kilham rat virus Zipris et al, 2007
    Measles Virus Harcourt et al, 1999
    Molony Murine Leukemia Virus Pak & Faller, 1996
    mRNA (in vitro transcribed) Kariko et al, 2004
    Newcastle disease virus Ten et al, 1993
    Porcine arterivirus Lee & Kleiboeker, 2005
    Rabies virus Nakamichi et al, 2005
    Reovirus Sperry et al, 2009
    Respiratory Syncytial Virus Mastronarde et al, 1996; Garofalo et al, 1996; Ennanciri et al, 2006
    Rhinovirus Zhu et al, 1996
    SARS coronavirus Cinatl et al, 2005; Liu et al, 2007
    Sendai paramyxovirus Hiscott et al, 1989
    Shope Fibroma Virus Dorfleutner et al, 2007
    Sindbis Virus Lin et al, 1995
    Vaccinia Virus Akara Guerra et al, 2004
    Veesicular stomatitis virus Georgel et al, 2007
    West Nile Flavavirus Kesson & King, 2001

    Viral Products
    Product Reference
    Adenovirus 5: E1A Shurman et al, 1989
    Adenovirus: E3/19K Pahl et al, 1996
    Adenovirus type 5: fiber Tamanini et al, 2006
    African Swine Fever Virus: IAP Rodriguez et al, 2002
    Antibody to Dengue Virus nonstructural protein 1 Lin et al, 2005
    CMV: ie1 Sambucetti et al, 1989
    Double-stranded RNA Visvanathan & Goodbourn, 1989
    Ebola: viral matrix & glycoprotein Martinez et al, 2007
    EBV: EBER small RNAs Scala et al, 1993
    EBV: EBNA-2 Samanta et al, 2006
    EBV: LMP1 Hammarskjöld & Simurda, 1992
    HBV: e antigen Yang et al, 2006
    HBV: HBx Twu et al, 1989
    HBV: LHBs Hildt et al, 1996
    HBV: MHBst Meyer et al, 1992
    HCV: Core protein You et al, 1999
    HCV: NS3 Hassan et al, 2006
    Herpes Saimiri: HVS13 Yao et al, 1995
    Herpes Saimiri: STP-A11 Cho et al, 2006; Jeong et al, 2007
    Herpes Saimiri:StpC Sorokina et al, 2004; Chung et al, 2007
    HIV-1: gp160 Chirmule et al, 1994
    HIV-1: gp120 Alvarez et al, 2005
    HIV-1: Nef Messmer et al, 2002; Varin et al, 2003
    HIV-1: p9 (9 aa peptide) De Lucca et al, 2002
    HIV-1: Tat Westendorp et al, 1994; Lee et al, 2005; Song et al, 2007
    HIV-1: Vpr Varin et al, 2005
    HPV-16: E6 James et al, 2006
    Herpes simplex-I: ICP27 Hargett et al, 2006
    HTLV-I: Tax Ballard et al, 1988; Leung & Nabel, 1988
    HTLV-II: Tax Tanaka et al, 1996
    Influenza Virus: Hemagglutinin Pahl & Baeuerle, 1995
    KSHV: K1 Prakash et al, 2005
    Parvovirus B19: NSI Moffatt et al, 1996
    Respiratory Syncytial Virus: M2-1 Reimers et al, 2005
    SARS: nuclcocapsid Liao et al, 2005
    SARS: non-structural protein-1 Law et al, 2006
    SARS: Spike protein Liu et al, 2007
    Shope Fibroma virus: vPOP Dorfleutner et al, 2007
    SV40: small T-antigen Johannessen et al, 2003
    VSV: glycoprotein G Georgel et al, 2007

    Eukaryotic parasites
    Organism Reference
    Eimeria tenella and Eimeria necatrix del Cacho et al, 2004
    Entamoeba histolytica Kammanadiminti et al, 2007
    Leishmania (lipophosphglycan) Becker et al, 2003
    Opisthorchis viverrini Pinlaor et al, 2006
    Phospholipomannan (C. albicans) Jouault et al, 2003
    Pneumocystis Zhang et al, 2004
    Taenia solium larva Uddin et al, 2006
    Theileria parva Ivanov et al, 1989; Heussler et al, 2001
    Trypanoplasma borreli Saeij et al, 2003

    (Inflammatory) Cytokines and Cytokine Receptors
    Molecule Reference
    CD30 Aizawa et al, 1996
    Salivary cystatins (SA1 and SA2) Kato et al, 2002
    IL-1 Osborn et al, 1989; Kida et al, 2005
    IL-2 Hazan et al, 1990
    IL-4 Lee et al, 2005; Jang & Lee, 2006
    IL-12 Grohmann et al, 1998
    IL-15 McDonald et al, 1998
    IL-17 Shalom-Barak et al, 1998
    IL-18 Matsumoto et al, 1997; Reddy et al, 2007
    IL-21 Caruso et al, 2007
    IL-32 Dinarello & Kim, 2006
    IL-33 Iikura et al, 2007
    LIF Gruss et al, 1992
    LIGHT (TNF-like molecule) Zou et al, 2005
    p43 Ko et al, 2001
    Pentraxin-3 Napoleone et al, 2004
    S100B Lam et al, 2001
    Human septic serum Kumar et al, 2005
    THANK Mukhopadhyay et al, 1999
    Thrombopoietin Romanelli et al, 2005
    TNFa Osborn et al, 1989; Israël et al, 1989
    TNFb Messer et al, 1990
    TWEAK (TNF-like weak inducer of apoptosis) Jin et al, 2004
    Visfatin Moschen et al, 2007; Adya et al, 2008

    Physiological (Stress) Conditions
    Condition Reference
    Acidic pH Bischoff et al, 2008
    Acute lung injury/respiratory distress syndrome Manning et al, 1995
    Adhesion Lin et al, 1995
    Angina pectoris Valen et al, 2001
    Antiphospholipid antibodies Espinola et al, 2003; Lopez-Pedrera et al, 2005
    Appendicitis Pennington et al, 2000
    Low arginine Kagemann et al, 2007
    Asthma Hart et al, 1998
    Biotin deficiency Griffin & Zempleni, 2005
    Butter and Walnut diet Bellido et al, 2004
    Cecal ligatin and puncture (mouse) Williams et al, 1999
    Crohn's disease/ulcerative colitis Rogler et al, 1998
    Corneal epidemic keratoconjunctivitis Kase et al, 2004
    Coronary artery by-pass Meldrum et al, 2003
    Depolarization Kaltschmidt et al, 1995; Valdes et al, 2006
    Pulsed electromagnetic fields Natarajan et al, 2006
    Static electromagnetic field Sakurai et al, 2007
    Hemorrhage Shenkar et al, 1996; Shenkar & Abraham, 1997
    Hypercholesterolemia Wilson et al, 2000
    High-protein/high carbohydrate diet van Erk et al, 2006
    Hyperglycemia Pipeir & Riaz-ul-Haq, 1997; Yerneni et al, 1999; Dickinson et al, 2008
    Hyperhomocysteinemia (homocysteine) Zhang et al, 2004; Zeng et al, 2005; Zhang et al, 2006; Carluccio et al, 2007
    Hyperosmotic Shock Courtois et al, 1997
    Hyperoxia Shea et al, 1996; Dieperink et al, 2006
    Hypothermia Fairchild et al, 2005
    Hypoxia (chronic intermittent) Greenberg et al, 2006
    Ischemia (transient, focal) Gabriel et al, 1999; Li et al, 1999
    Ischemic preconditioning Zhang et al, 2003
    Liver Regeneration Tewari et al, 1992; Cressman et al, 1994
    Human labor (childbirth) Allport et al, 2001
    Mechanical Ventilation (in vitro) Pugin et al, 1998
    Memory retrieval Merlo et al, 2005
    Middle cerebral artery occlusion Zhang et al, 2005
    Muscle disuse Hunter et al, 2002
    Muscular Dystrophy (type 2A) Baghdiguian et al, 2001
     Neuronal firing Lerner-Natoli et al, 2000
     Overventilation (perfused lungs) Uhlig et al, 2002
    Pancreatitis Gukovsky et al, 1998
    Proteinuria Praga & Morales, 2002; Abbate et al, 2006; Takase et al, 2008
    Reoxygenation Rupec & Baeuerle, 1995
    Rheumatoid arthritis Miyazawa et al, 1998
    Senescence (keratinocytes) Bernard et al, 2004
    Shear stress Lan et al, 1994
    Obstructive sleep apnea Htoo et al, 2006; Yamauchi et al, 2006
    Neuoronal trimethyltin injury Kassed et al, 2004
    Uni-axial cyclic cell stretching Inoh et al, 2002
    T-cell selection Moore et al, 1995
    Tert-butyl hydroperoxide Lee et al, 2005

    Physical Stress
    Condition Reference
    Acoustic overstimulation Nagashima et al, 2007
    Bile duct ligation Zhong et al, 2002; Samuel et al, 2006
    Cyclic mechanical muscle strain Kumar et al, 2004; Liang et al, 2006
    Double-strand DNA breaks Habraken & Piette, 2006
    Exercise Hollander et al, 2001; Toldy et al, 2005; Garcia-Lopez et al, 2007
    Gamma Radiation Brach et al, 1991
    Heavy ion irradiation Mitra et al, 2004
    High fat diet Zhang et al, 2004
    Laminar shear stress Chen et al, 2003
    Dietary lipid hydroperoxide Tsujinaka et al, 2005
    PPME Photosensitization Legrand-Poels et al, 1995
    Ultraviolet irradiation (UV-A, B, C) Stein et al, 1989
    Mechanical lung ventilation Uhlig et al, 2002
    Mesangial cell stretching Gruden et al, 2005
    Obesity Ghanim et al, 2004
    Photocynamic therapy Stott & Korbelik, 2006
    Shock waves Sonden et al, 2006
    Simulated microgravity environment Wise et al, 2005; Sharma et al, 2008
    Sleep deprivation Brandt et al, 2004; Irwin et al, 2008
    Split dose radiation Liu et al, 2006
    Traumatic brain injury Hang et al, 2005
    Vein graft handling Hinokiyama et al, 2006
    Vitamin E deficiency Morante et al, 2005
    Water-solube hat-stacked carbon nanofibers Sato et al, 2005
    Wounding combined with HeNe irradiation Haas et al, 1998
    Wounding combined with thermal irradiation Nomoto et al, 2001

    Oxidative Stress
    Condition Reference
    Butyl Peroxide Munroe et al, 1995
    Cerulein Yu et al, 2002
    Glutathione Hehner et al, 2000
    Hydrogen Peroxide Schreck et al, 1991
    Ozone Haddad et al, 1996
    Peroxynitrite Cooke & Davaidge, 2002
    Pervanadate Imbert et al, 1996
    Reoxygenation Rupec & Baeuerle, 1995

    Environmental Hazards
    Condition Reference
    Ambient air particles Sama et al, 2007
    Aroclor 1254 (PCB mixture) Basha et al, 2005
    Arsenic Huang et al, 2001, Ouyang et al, 2005; Fry et al, 2007; Klei & Barchowsky, 2008
    3,3',4,4'-tetrachlorobiphenyl (PCB77) Hennig et al, 1999; Bezdecny et al, 2007
    Benzo[a]pyrene diol epoxide Weng et al, 2004; Ouyang et al, 2006; Bolotina et al, 2007; Ding et al, 2007
    Areca nut extract (betel) Lin et al, 2005; Lu et al, 2006; Tseng et al, 2008
    Carbon nanotubes Manna et al, 2005
    Chromium Ye et al, 1995
    Cigarette smoke Nishikawa et al, 1999; Zhang et al, 2007; Preciado et al, 2007
    Cigarette smoke condensate Anto et al, 2002
    Cobalt Goebeler et al, 1995; Kalpana et al, 2008
    Cooking oil fumes Hung et al, 2005
    Copper Persichini et al, 2006
    Crocidolite asbestos fibers Janssen et al, 1995
    Dibutyl phthalate Tharappel et al, 2001
    Dicamba (herbicide, peroxisome proliferator) Espandiari et al, 1998
    Diesel exhaust particles Marano et al, 2002; Kafoury & Madden, 2005
    Gemfibrozil Tharappel et al, 2001
    Gliadin (from wheat) Jelinkova et al, 2004
    House dust mite (allergen Der p1) Chen et al, 2003; Wong et al, 2006
    Dust particles Churg & Wright, 2002
    Fear-potentiated startle response Yeh et al, 2002
    Iron She et al, 2002; Cornejo et al, 2005; Ornstein & Zacharski, 2007
    Lead Ramesh et al, 1999
    Lead chromate Leonard et al, 2004
    Manganese Ramesh et al, 2002; Liao et al, 2006
    Mechanical stress Liang et al, 2006
    Motor cycle exhaust particles Lee et al, 2005
    Nickel Goebeler et al, 1995
    Nitroglycerin Greco et al, 2005
    Noise Ramkumar et al, 2004
    Oily fly ash Quay et al, 1998
    Ricin Wong et al, 2007
    Safrole Ni et al, 2006
    Silica Particles Chen et al, 1995
    Smokeless tobacco Sharma et al, 2006
    Wood smoke Leonard et al, 2000
    Zymosan (yeast cell wall product) Sato et al, 2003

    Therapeutically used drugs
    Compound Reference
        ABR-25757 (oxo-quinoline-3-carboxamide) Carlsten et al, 2004
         2-(1-adamantylamino)-6-methylpyridine  (AdAMP) Lasek et al, 2002
         2-(4-Amino-3-methylphenyl)-5-fluoro-benzothiazole Brantley et al, 2005
    1-b-D-Arabinofuranosyl-cytosine (ara-C)) Strum et al, 1994
    Anthralin Schmidt et al, 1996
    Azidothymidine (AZT) Kurata, 1994
    Baicalein Chou et al, 2003
    Bleomycin Ishii & Takada, 2002
    Bryostatin-1 Do et al, 2004
    Bucillamine metabolite SA 981 Distler et al, 2004
    Camptothecin Piret & Piette, 1996
    Celecoxib Kim et al, 2004; van Wijngaarden et al, 2006
    Ciprofibrate Li et al, 1996
         Cisplatin Nie et al, 1998; Yu et al, 2008
         Clonidine Su et al, 2008
         Cycloprodigiosin Teshima et al, 2004
             Dacarbazine Lev et al, 2003
             Daio-Orengedeokuto Cho et al, 2004
    Daunomycin Das & White, 1997; Hellin et al, 1998
    Daunorubicin Wang et al, 1996
    Diazoxide Eliseev et al, 2004
    Diclofenac Cho et al, 2005
    5,6-dimethylxanthenone-4-acetic acid Ching et al, 1999
    Doxorubicin Das & White, 1997
              Epinephrine Lymperopouos et al, 2006
              Etoposide Bessho et al, 1994
    Flavone-8-acetic acid Ching et al, 1999
    Gemcitabine Hernandez-Vargas et al, 2006
    Haloperidol Post et al, 1998
    Imiquimod Schon & Schon, 2006; 2007
    Isochamaejasmin Tian et al, 2005
    Kagamjuaguiem An et al, 2007
    Kunbi-Boshin-Hangam-Tang Koo et al, 2001
    Lithium Nemeth et al, 2001
    Methamphetamine Asanuma & Cadet, 1998
    Mitoxantrone Boland et al, 2000
    Morphine (+amitriptyline) Yin et al, 2006; Tai et al, 2008
    Nipradilol Ando et al, 2005
    Norepinephrine Minneman et al, 2000
    Nystatin Ogawa et al, 2005
    Oltipraz Nho & O'Dwyer, 2004
    Phenobarbital Li et al, 1996
    Proteasome inhibitors Dolcet et al, 2006
    Protocatechuic acid (from herb radix Salviae miltiorrhizae) Zhou-Stache et al, 2002
    SN38 (metabolite of CPT-11) Kishida et al, 2004
    Tamoxifen Ferlini et al, 1999
    Taxol (Paclitaxel) Hwang & Ding, 1995
    Vinblastine Rosette & Karin, 1995
    Vincristine Das & White, 1997
    WR1065 Grdina et al, 2002

    Modified Proteins
    Protein Reference
    Advanced glycated end products (AGEs) Yan et al, 1994; Wautier et al, 1994
    Amyloid Protein Fragment (bA4) Behl et al, 1994; Kawamoto et al, 2007
    Anti-PR3 Mayet et al, 1999
    Elastin fragments Debret et al, 2006
    c-FLIP N terminus Golks et al, 2006
    Glycosylated oxyhaemaglobin Peiro et al, 2003
    Maleylated Bovine Serum Albumin Misra et al, 1996
    Modified (Oxidized)LDL Rajavashisth et al, 1995; Andalibi et al, 1993
    Neurotrophin Receptor proteolytic fragments Kanning et al, 2003
    Non-amyloid beta component of Alzheimer's Disease Tanaka et al, 2002

    Overexpressed Proteins (ER Overload sometimes)
    Protein Reference
    Astrocyte elevated gene-1 (AEG-1) Emdad et al, 2006
    BRAF-V600E mutant Palona et al, 2006
    Cleaved caspase-8 and -10 Takahashi et al, 2006
    CFTR (mutant deltaF508) Knorre et al, 2002
    Diacylglycerol kinase alpha Yanagisawa et al, 2007
    Erythropoietin Receptor Knorre & Pahl, unpublished observation
    FBI-1 Lee et al, 2005
    Flt3 Takahashi et al, 2005
    GPR56 (aka TM7XN1) Shashidhar et al, 2005
    Hematopoietic progenitor kinase 1 Arnold et al, 2001
    Ig heavy chain Pahl & Baeuerle, 1995
    MAVS Seth et al, 2005
    Md-9/syntenin Boukerche et al, 2007
    MHC Class I Pahl & Baeuerle, 1995
    NADPH oxidase 1 (Nox1) Fukuyama et al, 2005
    Parkin (an E3 Ub ligase) Henn et al, 2007
    Polycystin-1 Banzi et al, 2006
    Receptor tyrosine phosphatase beta Lorente et al, 2005
    Ribonucleotide reductase M2 subunit Duxbury & Whang, 2006
    S100A7 Emberley et al, 2005
    S100A8 and A9 Hermani et al, 2005; Benedyk et al, 2007
    TROY Hisaoka et al, 2006

    Receptor Ligands
    Ligand Reference
    Agonist antibodies to AT1-Receptor Dechend et al, 2005
    5-androstenediol Xiao et al, 2007
    Antigen (IgM-Ligand) Marcuzzi et al, 1989
    Anti-thrombomodulin antibodies Nara et al, 2006
    BAFF (B cell-activating factor) Claudio et al, 2002
    CD1d ligation Yue et al, 2005
    Beta-D-glucan ligand Battle et al, 1998
    CD11b/CD18-Ligand (Complement) Thieblemont et al, 1995
    CD28-Ligand (B7-1) Verweij et al, 1991
    CD2-Ligand Bressler et al, 1991
    CD35-Ligand (Complement) Thieblemont et al, 1995
    CD3-Ligand Tong-Starksen et al, 1990
    CD40-Ligand Berberich et al, 1994
    CD43-Ligand Santana et al, 2000
    CD4-Ligand (gp120) Chirmule et al, 1994
    CD66a-Ligand  Donda et al, 2000
    M3 Cholinergic receptor agonist  Zhang et al, 2004
    Cysteinyl-leukotrines Thompson et al, 2006
    Defensins Yang et al, 2009
    Fc-2a-Receptor-Ligand (IgG2a) Muroi et al, 1994
    Flt-1-Ligand Reikerstorfer et al, 1995
    Heat shock protein 60 (HSP60) Billack et al, 2002
    Ly6A/E-Ligand Ivanov et al, 1994
    N-CAM Krushel et al, 1999
    PGG-Glucan (Betafectin) Adams et al, 1997
    Sphingosine 1-phosphate Siehler et al, 2001
    Thymosin-alpha 1 Peng et al, 2007
    Trail-receptor-1-Ligand (TRAIL) Schneider et al, 1997
    Trail-receptor-2-Ligand (TRAIL) Schneider et al, 1997
    Trail-receptor-4-Ligand (TRAIL) Degli-Esposti et al, 1997

    Apoptotic Mediators
    Mediator Reference
    Anti-Fas/Apo-1 Rensing-Ehl et al, 1995
    Poly(ADP) Ribose Polymerase (PARP) Chiarugi & Moskowitz, 2003
    TRAIL Schneider et al, 1997

    Mitogens, growth factors and hormones
    Molecule Reference
    Bone morphogenic protein 2 Mohan et al, 1998
    Bone morphogenic protein 4 Mohan et al, 1998
    Connective tissue growth factor CCN2 Gao et al, 2005
    Corticotropin-releasing Hormone Zbytek et al, 2004
    Endothelin-1 Gerstung et al, 2007
    Epidermal Growth Factor Biswas et al, 2000; Sethi et al, 2007
    Estrogen/beta-estradiol Hirano et al, 2006
    Folicle Stimulating Hormone Delfino & Walker, 1998
    Gastrin Ogasa et al, 2003
    GMCSF Ebner et al, 2003
    Hepatocyte Growth Factor Yao et al, 2004; Kaibori et al, 2004; Shen et al, 1997
    Insulin Bertrand et al, 1995; Madonna et al, 2007
    Insulin-like growth factor 1 Liu et al, 2001
    Lysophosphatidic acid Raj et al, 2004; Hwang et al, 2006; Chen et al, 2008
    M-CSF Brach et al, 1991
    Mullerian Inhibiting Substance Hoshiya et al, 2003
    Nerve Growth Factor Wood, 1995; Carter et al, 1996
    Neurokinin A Sun et al, 2008
    Pigment epithelium-derived factor (PEDF) Yabe et al, 2001
    Platelet Activating Factor (PAF) Fernandes et al, 2003; Seo et al, 2006
    Platelet-Derived Growth Factor Olashaw et al, 1992
    Plant steroids (diosgenin, hecogenin, tigogenin) Corbiere et al, 2003
    Progastrin Rengifo-Cam et al, 2007; Umar et al, 2008
    Prostratin Williams et al, 2004
    Relaxin Ho et al, 2007
    Resistan Silswal et al, 2005
    All-trans retinoic acid Farina et al, 2002; Mathieu et al, 2005
    RET/PTC3 Fusion oncoprotein Russell et al, 2003
    S100B Adami et al, 2004
    Serum Baldwin et al, 1991
    Sulphatide (L-selectin crosslinker) Turutin et al, 2003
    TGF-alpha Lee et al, 1995
    TGF-beta2 Lu et al, 2004
    Thromboxane Wei et al, 2007

    Physiological Mediators
    Mediator Reference
    Acetaldehyde Hsiang et al, 2007
    Acrp30/adiponectin Tsao et al, 2003; Hattori et al, 2007; Tomizawa et al, 2008
    Activin A Sugatani et al, 2003
    Adenosine Porkka-Heiskanen et al, 2002
    Adiponectin Hug & Lodish, 2005; Haugen & Drevon, 2007
    Adrenomedullin Pleguezuelos et al, 2004; Hagi-Pavli et al, 2005
    AILb-A (from Aeginetia indica) Okamoto et al, 2004
    Albumin Drumm et al, 2002; Tang et al, 2003
    Alginate Yang & Jones, 2008
    Allergin Coward et al, 2004
    Alloferin Ryu et al, 2008
    Alloxan Zhang et al, 2003
    Amadori adducts  Nevado et al, 2005
    Amino acid analogs Kretz-Remy et al, 1998
    Anaphylatoxin C3a and C5a Pan, 1998
    Angiotensin II (+aldossterone) Li & Brasier, 1996; Li et al, 2006; Guo et al, 2006
    Angiotensin IV Esteban et al, 2005
    Angiotensin II type 1-receptor activating antibodies Dragun et al, 2005
    Anti-CD30 antibody 5F11 Boll et al, 2005
    Antiphospholipid antibodies Pierangeli et al, 2004
    Arachidonic acid Ramakers et al, 2007
    Areca nut extract Lin et al, 2004
    Arginine vasopressin Fan et al, 2007
    Autotaxin Lee et al, 2006
    Baicalin (plant compound) Park et al, 2004
    Basic calcium phosphate crystals McCarthy et al, 1998
    Bronchoalveolar lavage fluid Nys et al, 2002; 2005
    Bradykinin Pan et al, 1996
    Brusatol Cuendet et al, 2004
    Burn patient serum Li et al, 2005
    beta-carotene Palozza et al, 2003
    Catalase Jang et al, 2004
    C2-Ceramide (N-acetyl-sphingosine) Andrieu et al, 1995
    Cerulein Gukovsky et al, 1998; Steinle et al, 1999
    Chelidonium majus extract Chung et al, 2004
    Collagen lattice Xu et al, 1998
    Collagen Type I Lee et al, 1995
    Conditioned medium from macrophages Permana et al, 2006
    Corn silk Kim et al, 2005
    Cryptdins Lin et al, 2004
    Curcuma xanthorrhiza Roxb extract Kim et al, 2007
    Cystamine Tzang et al, 2008
    Cysteinyl leukotrines Kawano et al, 2003
    Deoxycholic acid (bile acid) and derivatives Jenkins et al, 2003; Payne et al, 2006; Hirano et al, 2006
    Depression/early life stress Pace et al, 2006
    Des-Arg10-kallidin (B1 receptor agonist) Schanstra et al, 1998
    1,25-dihydroxycholecalciferol Adams & Teegarden, 2004
    Double-stranded polynucleotides Suzuki et al, 1999
    f-Met-Leu-Phe Browning et al, 1997
    Endosulfan Han et al, 2007
    Epimedium flavonoids Liu et al, 2006
    Exosomes secreted from monocytes Matsumoto et al, 2004
    Fibrinogen Guo et al, 2004
    Ferulic acid derivative Ronchetti et al, 2006
    Fenretinide Hewson et al, 2005
    Free fatty acids Tripathy et al, 2003
    Ganoderma lucidum Kuo et al, 2005
    Genistein Borras et al, 2006
    Geranylgeranylacetone Nishida et al, 2007
    Ginsenosides Ge et al, 2007
    (High) glucose Iwasaki et al, 2007
    beta-glycyrrhetinic acid Shaneyfelt et al, 2006
    Halothane Brasil et al, 2006
    Heat shock protein 25 (Hspb1) Yi et al, 2002
    Heat shock protein 60 (HSP 60) Kol et al, 1999
    Hemoglobin Simoni et al, 1998; Ogasawara et al, 2009
    Hericium erinaceum extract Son et al, 2006
    Histamine Tanimoto et al, 2007
    Homocysteine Mercie et al, 2000
    Hyaluronan Noble et al, 1996; Scheibner et al, 2006
    Hydrogen sulfide Zhang et al, 2007; Zhi et al, 2007
    12(R)-Hydroxyeicosatrienoic acid Laniado-Schwartzman et al, 1994
    20-Hydroxyeicosatrienoic acid Ishizuka et al, 2007
    6-Hydroxydopamine Park et al, 2004
    hPepT1 (apical di-/tripeptide transporter Vavricka et al, 2004
    Kainic acid (Kainate) Kaltschmidt et al, 1995; Lubin et al, 2005
    Lactate Miller et al, 2007
    Laminin Armstrong et al, 2008
    Leukotriene B4 Brach et al, 1992; Huang et al, 2004
    L-Glutamate Guerrini et al, 1995
    Lipid ozonation products Kafoury et al, 2007
    Long-term potentiation (LTP) Freudenthal et al, 2004
    Lysophosphatidylcholine (LysoPC) Zhu et al, 1997; Ryborg et al, 2005
    alpha-mangostin Shaneyfelt et al, 2006
    Melanin (from plants) Pugh et al, 2005
    Mixed meal ingestion (high glucose) Aljada et al, 2004; Schiekofer et al, 2006
    Monosodium urate crystals Jaramillo et al, 2004
    Monocrotaline (plant toxin) Iwasaki et al, 2005
    Neuromelanin Wilms et al, 2003
    Neurotensin Zhao et al., 2005
    Neutrophil elastase Walsh et al, 2001
    Nitric oxide Hemish et al, 2003
    NSAIDS (sulindac, sulindac sulfone, indomethacin) Loveridge et al, 2007
    NS-398 (high dose) Moalic-Juge et al, 2002
    Nucleotide activation of P2 receptors Korcok et al, 2005
    Oleic acid Park et al, 2003
    Optunia polyacantha (prickly pear) polysaccharides Schepetkin et al, 2008
    Osteopontin Philip et al, 2001; Philip & Kundu, 2003
    PAF (platelet activating factor) Smith & Shearer, 1994; Mutoh et al, 1994
    Palmitate Cacicedo et al, 2004; Ajuwon & Spurlock, 2005; Xu et al, 2007; Laine et al, 2007; Ishikado et al, 2009
    PCSC (polysaccharide from Poria cocos) Lee et al, 2004
    Phellinus linteus proteoglycan Kim et al, 2004
    Pingyangmycin Wu et al, 2006
    Plaunotol Fu et al, 2005
    Platelet type arachidonate 12-lipoxygenase Kandouz et al, 2003
    Polysaccharides of Poria cocos Lee & Jeon, 2003
    Polysaccharides of Astragalus membranaceus Lee & Jeon, 2005
    Potassium Kaltschmidt et al, 1995
    Prolacting and Prolactin N-terminal fragment (16K PRL) Macotela et al, 2002'; Boutet et al, 2007; Tabruyn et al, 2007
    Proteolysis-inducing factor (PIF) Watchorn et al, 2002
    Rapamycin Dichtl et al, 2005
    Regulatory RNA Watanabe et al, 2003
    Rev-erbalpha Migita et al, 2004
    Rhodiola rhizome aqueous extract Mishra et al, 2006
    S100B Kogel et al, 2004
    Salsolinol Wanpen et al, 2007
    Saturated fatty acids Lee et al, 2003
    Scopoletin (6-methoxy-7-hydroxycoumarin) Kim et al, 2005
    Serum amyloid A Jijon et al, 2005
    Solanum nigrum An et al, 2005
    St John's Wort (hyperforin) Zhou et al, 2004
    Streptozotocin Choi et al, 2002
    Substance P Guo et al, 2002
    Tansy floret polysaccharides Xie et al, 2007
    Tauroursodeoxycholic acid (TUDCA) Rodrigues et al, 2003; Toledo et al, 2004
    T-cell costimulatory receptor 4-1BB Lee et al, 2002
    Thioredoxin Hirota et al, 1999
    Tetrandine Liou et al, 2008
    Thrombin Mari et al, 1994
    Titanium and copper implants Suska et al, 2004
    Trypsin (+SLIGRL) Bretschneider et al, 1999
    Tuberous sclerosis complex Maldonado et al, 2003
    Uremic toxins   Motojima et al, 2003
    Uric acid  Han et al, 2006
    Very Low density Lipoproteins (VLDL)   Norata et al, 2003
    Violacein  Ferreira et al, 2004
    Vitamin D3 Berry et al, 2002; van Etten et al, 2007; Tse et al, 2007
    White wine Thirunavukkarasu et al, 2008
    Zinc Kim et al, 2006; Bao et al, 2007; Rudolf & Cervinka, 2008

    Chemical Agents
    Compound Reference
    2-Deoxyglucose Pahl & Baeuerle, 1995
    Acenaphthenequinone Chung et al, 2006
    Adriamycin Sen & Baltimore, 1986; Li et al, 2007
    Agarose Yoshida & Babensee, 2006
    Aluminum Campbell et al, 2004; Lukiw et al, 2005
    Anisomycin Andriollo et al, 2003
    5-azidooxantheonone-4-acetic acid, 5-azido-6-methlxantheonoe-4-acetic acid Palmer et al, 2007
    Benzyl isothiocyanate Patten & DeLong, 1999
    Betulinic acid Kasperczyk et al, 2005
    Bisperoxovanadium (bpV) phosphotyrosyl phosphatase inhibitors Ouellet et al, 2003; Castaldi et al, 2007
    Brefeldin A Pahl & Baeuerle, 1995
    1-Bromopropane Han et al, 2007
    Cadmium Jeong et al, 2004; Hyun et al, 2007
    Colchicine Rosette & Karin, 1995
    Calcium Ionophore plus phorbol ester Novak et al, 1990
    Calyculin A Suzuki et al, 1994
    Ceramide-beta-galactose Chang et al, 2002
    2-chloroethyl ethyl sulfide (mustard analog) Chatterjee et al, 2003
    Cobalt chloride Sultana et al, 1999
    Con A Rattner et al, 1991
    2-cyano-3,12-dioxooleana-1,9-dien-28-oic acid Ray et al, 2006
    Cycloheximide Sen & Baltimore, 1986
    Cyclopiazonic Acid Pahl et al, 1996
    Deferoxamine Lee et al, 2008
    Diquat Anton et al, 2002
    2,4-dinitrofluorobenzene Cruz et al, 2002
    DMXAA (5,6-dimethylxanthenone-4-acetic acid) Woon et al, 2006
    Ethanol Mandrekar et al, 1997; Munstonen et al, 2007
    Ferrocene Kovjazin et al, 2003
    Fluoride Zhang et al, 2008
    Forskolin Delfino & Walker, 1998
    Gadolinium chloride Rose et al, 2001
    Glass fibers Ye et al, 1999
    HDAC inhibitors (sodium butyrate and trichostatin A) Mayo et al, 2003
    Linoleic acid Hennig et al, 1996
    Lipoplex Kuramoto et al, 2005
    L-NMA Peng et al, 1995
    Lysophosphatidic acid Shahrestanifar et al, 1999
    Malondialdehyde Oh et al, 2001
    MDMA ("Ecstacy") Montiel-Duarte et al, 2004: Tiangco et al, 2005
    MEN 17055 (disaccharide anthracycline) Camarda et al, 2002
    Monensin Pahl & Baeuerle unpublished observation
    N-methyl-D-aspartate Guerrini et al, 1995
    Mycophenolic acid Weigel et al, 2002
    Nafenopin West et al, 1999
    Nickel sulfate  Cruz et al, 2004
    Nicotine Crowley-Weber et al, 2003; Barr et al, 2006
    N-nitrosomorphine Tudzarova-Trajkovska & Wesierska-Gadek, 2003
    Nocodazol Rosette & Karin, 1995
    Nucleotide analogs (HPMPA; HPMPDAP) Potmesil et al, 2006
    Okadaic Acid Thevenin et al, 1990
    Peplomycin Yamamoto et al, 2001
    PD153035 (EGFR inhibitor) Woodworth et al, 2005
    PHA Sen & Baltimore, 1986
    Phorbol ester Sen & Baltimore, 1986
    Phosphodiester CpG DNAs Yu et al, 2002
    Pine mushroom culture Kim et al, 2008
    Podophyllotoxin Rosette & Karin, 1995
    Poloxamer (pluronic) Kabanov et al, 2005
    Polychlorinated biophenyl-77 Glauert et al, 2005
    Polysiphonia japonica extract Gwak et al, 2006
    Prostratin (a phorbol ester) Rullas et al, 2004
    Pyrogallol Adcock et al, 1994
    Resveratrol Uchida et al, 2005
    Quercetin (high concentrations) Shih et al, 2004
    Quinolinic acid Qin et al, 1998
    Safflower polysaccharides Ando et al, 2002
    Sanglifehrin A Zhang et al, 2001
    Sodium nitroprusside Kim et al, 2005
    Staurosporine Chabot-Fletcher & Breton, 1998
    Styrene Roder-Stolenski et al, 2008
    Suberoylanilide hydroxamic acid Liu et al, 2006
    Sulfur mustard Rebholz et al, 2008
    Tetramethylpyrazine Yang et al, 2005
    Thapsigargin Pahl et al, 1996
    Transglutaminase 2 Lee et al, 2004
    Tunicamycin Pahl & Baeuerle, 1995
    cis-urocanic acid Kaneko et al, 2008
    Vinblastine Rosette & Karin, 1995
    WF10 Giese et al, 2004
    WY-14,643 (peroxisome proliferator) Rusyn et al, 1998; Tharappel et al, 2001
       In addition to the list above, Matsuda et al (2003) have identified 83 cDNAs that can induce NF-kB reporter gene activity upon transfection.  (Matsuda et al, 2003, Large-scale identification and characterization of human genes that activate NF-kB and MAPK signaling pathways. Oncogene 22 3307-3318)